法国科研中心细菌生化实验室

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吴龙飞, 主任研究员

电话: +33 (0)4 91 16 41 57 

传真: +33 (0)4 91 71 89 14 

E-mail: wu@ifr88.cnrs-mrs.fr   

 学习及工作经历 

1978-1982:  山东大学生物系、微生物专业(学士) 

1983-1984:   法国里昂国家应用科学院 生化系 微生物研究室(硕士) 

1984-1988:   法国里昂国家应用科学院 生化系 微生物研究室(博士) 

1988-1990:   美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校生物系(博士后) 

1992:        法国里昂第一大学 博导资格(HDR) 

1990-1995    法国里昂国家应用科学院微生物遗传学实验室 研究员 

1995-:       马赛结构生物学微生物学研究所细菌化学实验室 主任研究员 

科研经历 

1990-1995:      大肠杆菌的镍代谢系统 

1995-2008:      细菌折叠蛋白的输送机理 

2003-:          趋磁细菌磁生物多样性、趋磁机理和应用研究 

发表论文 

·         Pan W., Chen C., Wang X.K., Ma Q., Jiang W., Lv J., Wu L.-F. and Song T. (2009). Effects of pulsed magnetic field on the formation of magnetosomes in the Magnetospirillum magneticum AMB-1. Bioelectromagnetics. In press
·         Zhang L., Zhu Z., Jing H., Zhang J., Xiong Y., Yan M., Gao S., Wu L.-F., Xu J. and Kan B. (2009) Pleiotropic effects of the twin-arginine translocation system on biofilm formation, colonization, and virulence in Vibrio cholera. BMC Microbiology 2009, 9:114 doi:10.1186/1471-2180-9-114
·         Lefèvre C.T, Song T., Yonnet J.P. and Wu L.-F. (2009). Characterization of bacterial magnetotactic behaviors using a magneto-spectrophotometry assay Appl. Environ. Microbiol. 75: 3835-3841.
·         Lefèvre C.T, Bernadac A., Yu-Zhang K., Pradel N. and Wu L.-F. (2009) Isolation and characterization of a magnetotactic bacterial culture from the Mediterranean sea. Environ. Microbiol. 11(7), 1646–1657
·         Pradel N., Delmas J., Wu L.-F., Santini C.-L., and Bonnet R. (2008). Translocation of different β-lactamases across Escherichia coli cytoplasmic membrane. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 53: 242-248.

·         Kikuchi Y., Itaya H., Date M., Matsui K. and Wu L.-F. (2009). TatABC overexpression improves Tat-dependent protein secretion in Corynebacterium glutamicum. Appl. Environ. Microbiol. 75: 603-607. 

·         Alphandery E., Anh-Tu. N., Lefèvre C., Lisiecki I., Wu L.-F. and Pileni M.P. (2008) Difference between the magnetic properties of the magnetotactic bacteria and those of the extracted magnetosomes: Influence of the distance between the chains of magnetosomes. J. Phys. Chem. 112: 12304-12309. 

·         Wang X.K., Ma Q.F., Jiang W., Lv J., Song T. and Wu L.-F. (2008). Effects of hypomagnetic field on magnetosome formation of Magnetospirillum magneticum AMB-1. Geomicrobiology Journal. 25: 296 – 303. 

·         Pan, H., Zhu, K., Song, T., Yu-Zhang, K., Lefèvre, C., Xing, S., Liu, M., Zhao, S., Xiao, T. and Wu, L.-F. (2008)Characterization of a homogeneous taxonomic group of marine magnetotactic cocci within a low tide zone in the China Sea. Environment. Microbiol. 10: 1158-1164
·         Taoka A., Asada R., Sasaki H., Anzawa K., Wu L.-F., and Fukumori Y. (2007) Polymerization of the actin-like protein MamK, which is associated with magnetosomes. J. Bacteriol. 189:8737-8740.
·         Kikuchi Y., Itaya H., Date M., Matsui K. and Wu L.-F. (2007). Production of Chryseobacterium proteolyticum protein-glutaminase using the twin-arginine translocation pathway in Corynebacterium glutamicum. Appl. Microbiol. Biotechnol. 78: 67-74.

·         Lefèvre C., Bernadac A., Pradel N., Wu L.-F., Y.-Zhang K., Xiao T., Yonnet J-P, Lebouc A., Song T. and Y. Fukumori (2007) Characterization of Mediterranean magnetotactic bacteria. J. Ocean Univ. China 6 :355-359. 

·         Perez-Rodriguez R., Fisher A.C., Perlmutter J.D., Hicks M. G., Chanal A., Santini C.-L., Wu L.-F., Palmer T. and. DeLisa M.P. (2007) An essential role for the DnaK molecular chaperone in stabilizing overexpressed substrate proteins of the bacterial twin-arginine translocation pathway. J. Mol. Biol. 3: 715-730.
·         Xiong Y., Santini C.-L., Kan B., Xu J., Filloux A. and Wu L.-F. (2007) Expression level of heterologous tat genes is crucial for in vivo reconstitution of a functional Tat translocase in Escherichia coli. Biochimie. 89: 676-85.
·         Zhao L., Wu D., Wu L.-F. and Song T. (2007). A simple and accurate method for quantification of magnetosomes in magnetotactic bacteria by common spectrophotometer. J. Biochem. Biophys. Methods 70: 377-383.
·         Pradel, N., Santini, C.-L., Bernadac, A., Shih, Y.-L., Goldberg, M. B., and Wu L.-F. (2007) Periplasmic space and polar positional information in Escherichia coli spherical cells. Biochem. Biophy. Res. Commun. 353: 493-500.
·         Pradel N., Santini C.-L., Bernadac A., Fukumori Y. and Wu L.-F. (2006) Biogenesis of actin-like bacterial cytoskeletal filaments destined for positioning prokaryotic magnetic organelles. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103:17485-17489.
·         Kikuchi Y., Date M., Itaya H., Matsui K. and Wu L.-F. (2006). Functional analysis of the twin-arginine translocation pathway inCorynebacterium glutamicum ATCC13869. Appl. Env. Microbiol. 72:7183-7192..
·         Gao J, Pan H, Xiao T, Barbier G, Wang Z, Yue H, Sun S, Nitsche S, Bernadac A, Pradel N, Wu  (2006) Isolation and characterization of novel marine Roseobacter clade members producing unique intracellular chromium-rich aggregates. Res. Microbiol. 157: 714-719.L.-F.
·         Taoka A., Asada R., Sasaki H., Anzawa K., Wu L.-F., and Fukumori Y. (2006) Spatial Localizations of Mam22 and Mam12 inthe Magnetosomes of Magnetospirillum magnetotacticum. J. Bacteriol. 188:3805-12.
·         Zhang F, Chen J, Chi Z and Wu L-F. (2006) Expression and processing of Vibrio anguillarum zinc-metalloprotease inEscherichia coli. Arch Microbiol. 186:11-20.
·         Chen M., Xie K., Yuan J., Yi L., Facey S.J., Pradel N., Wu L.-F., Kuhn A. and Dalbey R.E. (2005) Involvement of SecDF and YidC in the membrane insertion of M13 procoat mutants. Biochemistry. 44: 10741-10749.
·         Pradel N., Decorps A., Ye C-Y, Santini C.-L. and Wu L.-F. (2005) YidC-dependent translocation of green fluorescence protein fused to the FliP cleavable signal peptide. Biochimie. 87: 191-196.
·         Gérard F., Pradel N. and Wu L.-F. (2005) Bactericidal activity of colicin V is mediated by an inner membrane protein SdaC ofEscherichia coli. J. Bacteriol. 187: 1945-1950.
·         Pradel N., Ye C-Y and Wu L.-F. (2004) A cleavable signal peptide is required for the full function of the polytopic inner membrane protein FliP of Escherichia coli. Biochem. Biophys. Res. Commun. 319: 1276-1280.
·         Gérard F., Pradel N., Ye C-Y, Ize B., Yi L., Xu J. Dalbey R.E. and Wu L.-F. (2004) Putative membrane assembly of EtpM-colicin V chimeras. Biochimie. 86: 283-286.
·         Gouffi K., Gérard F., Santini C-L. and Wu L.-F. (2004) Dual topology of the Escherichia coli TatA protein. J. Biol. Chem. 279: 11608-11615.  
实验室成员:
 
 

SANTINI Claire-Lise, 工程师 

电话: 04 91 16 42 12 

E-mail: santini@ifr88.cnrs-mrs.fr 

研究方向:通过生物化学及细胞生物学等实验手段,研究趋磁细菌中细胞骨架和鞭毛的结构及功能,糖蛋白的合成、组装及结构。分析趋磁细菌的基因组。 

BERNADAC Alain, 工程师 

电话: 04 91 16 41 16 

E-mail: bernadac@ifr88.cnrs-mrs.fr 

研究方向:专长于利用显微镜观察研究细菌细胞结构,如细胞骨架、鞭毛、鞘和磁小体。 

PHILIPPE Nadège, 博士后 

电话: 04 91 16 42 12 

E-mail : nphilippe@ifr88.cnrs-mrs.fr 

研究方向: 以趋磁螺菌AMB-1为模式菌研究趋磁的分子机制,即如何感应磁力矩及将其转化为生化信号。同时研究MO-1生理特征。分析趋磁细菌的基因组。 

张维佳,博士生 

电话: 04 91 16 42 12 

E-mail: wzhang@ifr88.cnrs-mrs.fr 

研究方向: 通过遗传学分子生物学和生物化学等方法研究MO-1鞭毛的组装,结构及功能,糖蛋白的合成、分泌及组装。参与有关磁小体蛋白定位机制的工作分析趋磁细菌的基因组。 

张圣妲,博士生 

电话: 04 91 16 42 12 

E-mail: sdzhang@ifr88.cnrs-mrs.fr 

研究方向: 目前主要从事MO-1QH-2两株趋磁细菌的基因组分析、生理学及趋磁机理的研究 

    本实验室自2004年开始开展趋磁细菌方面的研究,研究方向主要集中在以下三个方面:海洋趋磁细菌的生物多样性,趋磁细菌细胞生物学研究以及趋磁机制的研究。  我们在地中海海域中发现了多样性很高的趋磁细菌,并从中成功分离得到趋磁细菌MO-1的纯培养,这是第一株分离自地中海的趋磁细菌。 
    
                                     
      在细胞生物学方面的研究中,利用荧光显微镜,电子显微镜及生物化学等方法,我们发现了MamK蛋白动态组装为磁小体链骨架微丝的过程。此外,我们利用MamC蛋白研究磁小体蛋白的定位机制。同JP Yonnet和宋涛实验室合作,我们开发出MSP方法应用于有关趋磁性的研究。
     现阶段,本实验室的主要课题为趋磁机制的研究,其中我们尤其关注“如何将磁力矩转换为生化信号”以及“鞭毛运动是如何响应磁信号”这两个方面。我们分别在轴向趋磁菌AMB-1和极向趋磁菌MO-1两株趋磁细菌中开展这部分工作。
    AMB-1的研究中,我们发现一个接受甲基化趋化蛋白(MCPsAmbmagnet与构成磁小体链骨架微丝的MamK蛋白有特异性相互作用。此外,在AMB-1细胞中超表达Ambmagnet会对AMB-1的趋磁行为产生影响。由此,我们推测MamK骨架能够将磁力矩由磁小体传递到Ambmagnet,从而将磁信号感应与趋化信号传导系统联系起来。
    在对新分离得到的MO-1菌株的研究过程中,我们发现氧化还原电位和磁场对趋磁细菌群体的趋磁极向起到一个筛选的作用。最近,我们还在MO-1细胞中观察到一种独特的鞭毛结构,该结构的组成成分,糖基化和分泌途径,及其结构和组装都将是我们下一步研究的重点。此外MO-1的基因组测序工作即将完成,我们正在进行基因组分析和注释的工作,这将帮助我们更好的了解趋磁细菌的进化过程,以及MO-1的一些相关信息。

 

 

马赛结构生物学微生物学研究所细菌化学实验室
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